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    純陽寶殿自建廟百二十餘年來,歷經數度整修,現為三層樓建築。目前的格局奠基於當時台灣傳統建築界之大師-陳應彬,陳應彬為當時台灣傳統寺廟建築的大師,指南宮純陽殿也成為應彬師後期的代表作品。

    純陽寶殿於1992年進行整修,修建時採用堅固耐久的大理石建材,屋頂則是首創南式建築中的銅瓦屋頂。一樓正殿供奉的是呂洞賓仙祖,中懸「天下第一靈山」題匾,殿內四周的龍柱則是從大陸泉州渡海而來,雕工細緻、栩栩如生;寶殿正後方的砌石圍牆中央,有一尊青斗石雕成的山龍龍頭,為鎮山的山神,時時守護著信眾的平安。